Перенос по IMAP — копирование, а не перемещение. Письма на источнике остаются нетронутыми от начала и до конца, что бы ни случилось с процессом.
Перед копированием инструмент сверяет, что уже есть на приёмнике, и пропускает совпадения. Поэтому второй запуск после обрыва не начинает всё сначала: он проходит по спискам, видит уже перенесённое и копирует только остаток.
Из этого же следует, что повтор дешёвый по времени. Если из десяти гигабайт успели переехать восемь, второй проход займёт время двух, а не десяти.